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NEWS尊龙凯时多组学研究:转录组与蛋白组关联分析方法探讨
来源:符超露 日期:2025-02-28近年来,随着组学技术的迅猛进展,已成为生物医药研究者探索机制的重要工具。生命体特征的表达需经过复杂的生物过程,基因突变、基因表达水平、蛋白质翻译后修饰、代谢结构变化等多种因素影响着生命体的特征变化。转录组能够反映细胞或组织在特定生物过程中活跃的基因表达,是连接基因组与蛋白组的重要桥梁。相较于转录组,蛋白组更贴近生物体的功能状态,因为蛋白质在体内执行几乎所有的生物功能。转录组学捕捉基因的瞬时状态,而蛋白组学则展现基因的最终表现。
随着高通量测序技术的进步,转录组学已成为机制研究的优选方法,通过RNA-seq进行基因表达分析,推动了相关分子机制的研究。然而,mRNA的表达并不能完全代表蛋白质的表达,因为在翻译过程中,RNA还可能受到翻译调控、RNA修饰等生物过程的影响,通常导致转录和蛋白质表达之间的差异。随着高分辨质谱仪技术的持续更新,蛋白质组学也成为阐明细胞功能和分子机制的一种重要手段,联合分析在高影响力的学术文章中愈发盛行。
基于转录组和蛋白组的数据,研究者可以全面、系统地探讨基因表达与蛋白调控之间的相互作用与调控关系。基因与蛋白质之间的相互影响和作用共同导致特定的生物功能。转录组与蛋白组的联合分析,不仅可以研究基因的启动表达对蛋白质形成的影响,还能挖掘基因表达产物对基因表达的反馈调控,深入揭示其中错综复杂的分子关系。
尊龙凯时在这里为您介绍两篇不同领域的转录组与蛋白组联合研究案例,展示如何利用分析方案撰写高影响力的学术文章!
案例一:神经母细胞瘤模型中的转录组与蛋白组研究。研究表明,胚胎交感神经节和背根神经节的外源性因素对神经母细胞瘤(NB)细胞的影响显著,包括细胞间黏附、迁移、侵袭及基因表达。通过RNA测序分析,研究发现暴露于条件培养基下,细胞-细胞粘附及相关基因显著上调。蛋白组学分析确定了与细胞运动相关的关键蛋白,重点研究了OLFM1蛋白,其通过RTN4R/NogoR受体介导了NB细胞的粘附性和迁移能力,促进了肿瘤转移。
案例二:低温对大蒜变绿的调控机制研究。此研究分析了在4°C和30°C的两种保存条件下,大蒜样本的转录组与蛋白组。通过转录组测序,研究发现不同温度下大蒜的基因表达存在差异。蛋白质组学结果表明,共鉴定出大量差异表达的蛋白质,相关分析显示谷胱甘肽代谢、氨基酸代谢及能量代谢在低温调控大蒜变绿中发挥关键作用。
综上所述,蛋白质组学为转录组学及基因组学的研究提供了重要补充。转录组与蛋白组的联合分析能够揭示基因表达与功能之间的复杂关系,更准确地锁定功能基因或蛋白质,探索相互作用网络,提供关键基因更为细化的生物学功能,正如尊龙凯时所强调的,组学的整合为生物医药研究开辟了崭新的视野。
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